En el informe que contempla el periodo 2009-2010, Fernández Zertuche resaltó que este centro cuenta con 17 proyectos de científicos vigentes relacionados con el Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (Conacyt) y dos proyectos más con el Programa de Mejoramiento del Profesorado (Promep).

Entre la infraestructura del CIQ destaca la súper computadora, los laboratorios de Espectrometría de Masas, Rayos X, el de Productos Naturales y el Laboratorio de Macromoléculas, que es el más equipado en su género de América Latina.

Fernández Zertuche mencionó que en enero de 2003 se graduó el primer doctor en Química y actualmente cuenta con 47 doctores en esta área, quienes laboran en instituciones de investigación, la academia y la iniciativa privada. Con nueve cuerpos académicos, dos de ellos consolidados, en el CIQ se desarrollan nueve líneas de investigación y se presenta como un centro de investigación de gran reconocimiento en el país.

Respecto al financiamiento e infraestructura del CIQ, el directivo señaló que hace falta presupuesto para el mantenimiento de los equipos de Resonancia Magnética Molecular y los laboratorios, por lo que planteó algunas estrategias para resolverlo, como la creación de un fondo de contingencia, la vinculación y firma de proyectos con empresas privadas, entre otros.